샷건 시퀀싱(Shotgun Sequencing)은 민간 기업인 셀레라 지노믹스(Celera Genomics)가 사용한 시퀀싱 방법이다. 셀레라 지노믹스의 창립자는 크랙벤터 박사이며, 92년까지 HGP(Human Genome Project)의 일원이었다. 그는 샷건 방법으로 더 효과적인 시퀀싱을 할 수 있다고 주장했지만 받아들여지지 않자 독자적으로 셀레라 지노믹스를 설립해서 자신이 주장한 샷건 방식으로 인간 유전자 지도를 만드는 작업에 착수하게 된다.
샷건 시퀀싱 방법은 다음과 같다. 먼저, 분석 대상이 되는 유전체를 여러개 준비하고, 이것을 각각 2000 bp와 10000 bp 단위로 잘라낸 그룹을 준비한다.
2000 bp로 잘려진 염기 서열과, 10000 bp로 잘려진 서열 각각을 플라스미드에 삽입한다.
그리고, 각각의 플라스미드의 시작과 끝 500 bp씩 읽는다.
이렇게 하면, 최종적으로 10000 bp 단위로 잘려진 염기 서열은 비교할 시작과 끝을 제공하며, 2000 bp로 잘려진 염기 서열은 BAC to BAC 방식과 비슷하게 이들의 조각을 맞춘뒤 이것이 전체적으로 어디쯤에 위치할 것인지는, 10000 bp 단위로 잘려진 염기 서열과 비교해서 파악할 수 있다. 이름과 참으로 비슷하다는 생각이 든다.
샷건 시퀀싱 방법은 다음과 같다. 먼저, 분석 대상이 되는 유전체를 여러개 준비하고, 이것을 각각 2000 bp와 10000 bp 단위로 잘라낸 그룹을 준비한다.
2000 bp로 잘려진 염기 서열과, 10000 bp로 잘려진 서열 각각을 플라스미드에 삽입한다.
그리고, 각각의 플라스미드의 시작과 끝 500 bp씩 읽는다.
이렇게 하면, 최종적으로 10000 bp 단위로 잘려진 염기 서열은 비교할 시작과 끝을 제공하며, 2000 bp로 잘려진 염기 서열은 BAC to BAC 방식과 비슷하게 이들의 조각을 맞춘뒤 이것이 전체적으로 어디쯤에 위치할 것인지는, 10000 bp 단위로 잘려진 염기 서열과 비교해서 파악할 수 있다. 이름과 참으로 비슷하다는 생각이 든다.
