DNA microarray는 분자 생물학이나 의약에서 사용되는 다층 기술이다. 이것은 기능(features)이라 불리는, 특정 DNA 서열의 아주 작은 부분을 포함하고 있는 DNA 올리고뉴클리오타이드(oligonucleotide) 배열의 집합으로 구성된다. 올리고뉴클리오타이드는 핵산 중합체(nucleic acid polymer)이며, 전형적으로 20개나 그 이하의 염기이다. 중합체란 공유 결합을 가진, 반복되는 구조체로 이루어진 커다란 분자를 말한다.
이것은, 특정 조건 아래에서 cDNA나 mRNA(타켓이라 불리는) 샘플을 하이브리드 하기 위한 probes로서의 DNA 원소나 유전자의 작은 지역(section)이 될 수 있다. 탐색-타켓 하이브리드는 타켓에서의 핵산 서열의 발현 관계를 결정하기 위한 라벨링된 타켓의 발견에 의해 탐색되고 양자화된다.
DNA microarray에는 수많은 DNA strands가 밀집되어 있으므로, 대량의 실험을 한번에 처리하는 것이 가능하다. 특히, 올리고뉴클리오타이드를 사용해서 DNA Chip을 구성했다면, 염기 서열이 하나만 틀려도 hybridization이 일어나지 않기 때문에 한 염기에 생긴 돌연변이를 찾을 수 있다. cDNA를 사용해서 DNA Chip을 구성했다면 알려진 gene의 발현 정도를 측정할 수 있다.
DNA microarray를 이용한 실험은, 여러가지 다른 조건, 예를 들어 시간의 경과 같은 변화에 따라 어떻게 유전자 발현이 달라지는지 파악할 수 있다. 그러나, DNA microarray를 이용한 실험은 노이즈가 상대적으로 높은 편에 속하기 때문에, 경우에 따라 통계적인 처리가 필요하다.
Reference
http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_microarray
이것은, 특정 조건 아래에서 cDNA나 mRNA(타켓이라 불리는) 샘플을 하이브리드 하기 위한 probes로서의 DNA 원소나 유전자의 작은 지역(section)이 될 수 있다. 탐색-타켓 하이브리드는 타켓에서의 핵산 서열의 발현 관계를 결정하기 위한 라벨링된 타켓의 발견에 의해 탐색되고 양자화된다.
DNA microarray에는 수많은 DNA strands가 밀집되어 있으므로, 대량의 실험을 한번에 처리하는 것이 가능하다. 특히, 올리고뉴클리오타이드를 사용해서 DNA Chip을 구성했다면, 염기 서열이 하나만 틀려도 hybridization이 일어나지 않기 때문에 한 염기에 생긴 돌연변이를 찾을 수 있다. cDNA를 사용해서 DNA Chip을 구성했다면 알려진 gene의 발현 정도를 측정할 수 있다.
DNA microarray를 이용한 실험은, 여러가지 다른 조건, 예를 들어 시간의 경과 같은 변화에 따라 어떻게 유전자 발현이 달라지는지 파악할 수 있다. 그러나, DNA microarray를 이용한 실험은 노이즈가 상대적으로 높은 편에 속하기 때문에, 경우에 따라 통계적인 처리가 필요하다.
Reference
http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_microarray
